Speaker
Description
Mit zunehmender Komplexität der Arbeitsabläufe in der Forschung steigt gleichzeitig der Bedarf an Werkzeugen, die wissenschaftliche Arbeit organisieren, dokumentieren und übertragbar machen können. Snakemake ist ein beliebtes, skriptbasiertes Workflow-Tool, das leicht zu erlernen, aber sehr flexibel und leistungsfähig ist, und dass Forschung sowohl lokal als auch im Cluster erleichtern und unterstützen kann. In diesem praktischen Workshop (oder Vortrag) wird gemeinsam ein ersten Snakemake-Workflow erstellt, die Denkweise von Snakemake genauer kennengelernt und viele seiner grundlegenden Funktionen vorgestellt. Es wird ein Beispiel aus der Bioinformatik verwendet, aber die erworbenen Fähigkeiten und Kenntnisse sind auf jede Disziplin übertragbar, in der verkettete Skripte und Workflows von Bedeutung sind.
| Zustimmung zu Streaming/Agree to streaming | ja/yes |
|---|---|
| Zustimmung zur Bereitstellung von Aufzeichnung/Agree to internal publication of recording | ja/yes |